Utbildningsdepartementets förslag om etableringsstopp för konfessionella friskolor kritiseras av DO och flera andra remissinstanser som Svenska advokatsamfundet, Lärarförbundet och Institutet för mänskliga rättigheter.
I mars 2022 lämnade regeringen ett förslag i en proposition till ändringar i skollagen som är tänkta att utöka kontrollen av religiösa inslag i skolväsendet. En promemoria med förslag om etableringsstopp för fristående skolor och fristående fritidshem med konfessionell inriktning sändes då till flera remissinstanser. I denna föreslås att det inte ska vara möjligt att utöka befintlig verksamhet för dessa skolor utöver vad som ryms inom ramen för godkännanden som de redan har fått. Ändringarna föreslås träda i kraft den 1 januari 2024.
Epoch Times har tagit del av promemorian. Där står att ”bland konfessionella skolor förekommer problem med brister kopplade till skolans demokratiuppdrag, jämställdhet, likvärdig utbildning samt till kravet på saklighet och allsidighet. Dessa problem är allvarliga.” Regeringen hänvisar till Skolinspektionens årsrapport 2021 som kritiserar att undervisningen inte har uppfyllt kravet på att vara icke-konfessionell. Skolinspektionen har på ett tiotal skolor genom åren sett att tiden för skolans val helt eller delvis otillåtet använts till annat än undervisning, såsom morgonsamlingar, fredagsbön eller kyrkobesök där konfessionella inslag ingått. Promemorian lyfter fram att det förekommit att undervisningen i biologi innehållit religiösa berättelser om människans och jordens ursprung som jämställts med vetenskapliga teorier om evolution och jordens tillkomst.